Pain, ao contrário do que muitos pensam era o líder da Akatsuki, o mais poderoso.
Na verdade Pain são seis corpos que compartilha da mesma consciência, sendo todos controlados por Nagato Uzumaki.
Quando pequeno, Nagato foi treinado por ninguém menos que Jiraiya, o sennin do sapo.
Nagato se uniu juntamente com seus companheiros órfãos de guerra para formar a Akatsuki,
uma organização cujos objetivos foram parar os ciclos infinitos de morte. Depois de seu amigo e líder, Yahiko, ser morto por pregar a paz.
Cujo verdadeiro nome é Obito Uchiha,
é o vice líder da Akatsuki que inicialmente age como um membro qualquer do grupo.
Ele aparece pela primeira vez como uma pessoa descontraída e brincalhona cujas ações muitas vezes resultam
em ser atacado por seu parceiro, Deidara.
Usando o pseudônimo de Tobi (トビ, Tobi) e Madara Uchiha,
Obito manipulou a Akatsuki das sombras para dar continuidade aos seus planos,
eventualmente, indo a público com eles e, no processo, iniciando a Quarta Guerra Mundial Shinobi
sendo manipulado pelo Zetsu Negro.
O irmão mais velho de Sasuke. Por ser do clã Uchiha possui um doujustsu muito poderoso, o Sharingan. Após ver seu melhor
amigo, Shisui Uchiha, se jogar de um penhasco, Itachi despertou uma forma evoluída do Sharingan, o Mangekyou Sharingan.
Após obter o Mangekyou Sharingan, recebeu ordens do alto escalão de Konoha para exterminar todos os membros do clã Uchiha,
porém obteve a ajuda de seu novo mestre, Tobi. Itachi não conseguiu matar seu irmão caçula, Sasuke.
Fez parte do grupo dos Sete Espadachins da Névoa, assim como Zabuza Momochi e Choujiro. Seu estilo de luta é
mesclado entre a utilização de sua espada, a Samehada e ninjutsu de suiton.
É um nukenin de Kiri.
Kisame era o ninja da Akatsuki que possuía mais chakra, sendo chamado de bijuu sem cauda. Após ficar seriamente ferido na
terceira luta contra Guy, Kisame entra em uma prisão de água,
e invoca três tubarões, para que o devorem, e assim não dá nenhuma informação sobre a Akatsuki.
Deidara é usuário de bakuton utilizando uma argila especial para lutar, é guardada dentro de uma bolsa presa a cintura. Com as duas bocas que possui em cada palma de suas mãos, Deidara modela a argila, inserindo seu chakra modificado dentro dela. Essa argila após ser expelida das duas bocas, geralmente possui a forma de algum animal, normalmente uma ave, mas podem ser aranhas, dragões, minas terrestres. Deidara entra na Akatsuki após desafiar e ser derrotado por Itachi Uchiha, Deidara após a batalha afirma que a arte de Itachi é superior a sua.
Sasori, também conhecido como Sasori da Areia Vermelha, é o primeiro membro da Akatsuki a morrer.
Ele entra para a Akatsuki logo depois de virar um nukenin, ao matar o Terceiro Grande Kazekage,
para transformá-lo em uma marionete.
A maioria das marionetes utilizadas por outros ninjas eram de sua criação, e ele as considerava como uma arte, porém imperfeita.
Sua arte tornou-se perfeita, sob seu ponto de vista, com a utilização e criação do Hitokugustsu,
que transformava um ser humano em uma marionete, mantendo suas habilidades de quando era vivo.
Foi voluntário de um kinjutsu, que na verdade eram experiências que as pessoas de sua religião faziam. Nesse kinjutsu, Hidan ganhou imortalidade. O seu principal jutsu, só é possível por causa de sua imortalidade. Ele usa a foice de três gumes que ele carrega, para tirar sangue do adversário. Depois ele ingere o sangue, e faz um símbolo no chão, e quando entra nele, todos os golpes que ele recebe, seu adversário também recebe.
Kakuzu tem uma técnica de estender sua vida. Com isso ele teve uma vida excepcionalmente longa. É tão velho que lutou contra o Primeiro Grande Hokage. Na verdade isso foi uma missão dada a ele pela Vila da Cachoeira, mas como falhou, foi punido e preso. Ao fugir da prisão, ele conseguiu essa técnica. Ele aumente sua vida, ao roubar o coração das pessoas, usando os inúmeros fios pretos de seu jutsu. Somado ao coração dele, o máximo de corações que ele pode ter, é cinco, tendo cinco vidas. Ou seja, teriam que matá-lo cinco vezes para poderem vencê-lo.
Amiga de infância de Nagato e Yahiko, os três foram alunos de Jiraiya quando esteve em Ameterra natal deles,
Jiraiya ensinou a eles as técnicas ninjas,
após três anos de treinamento ele partiu e deixou os três para fazer o seu próprio destino.
Ela foi uma das fundadoras da Akatsuki, junto com Nagato, e Yahiko, o principal fundador. Ela possui a habilidade de
controlar pedaços de papel e formar origamis para atacar o inimigo. Konan abandonou a Akatsuki após a morte de Nagato,
sendo posteriormente morta por Tobi, para entregá-lo o Rinnegan de Nagato.
É um dos membros da Akatsuki mais leais a Tobi. É na verdade dois seres independentes compartilhando o mesmo
corpo, sendo o Zetsu preto mais sério e inteligente, e o Zetsu branco mais despreocupado e alegre.
Ambas as partes foram criadas pela vontade de Uchiha Madara, sendo que a metade branca do Zetsu foi criada usando também as
células de Hashirama Senju.